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TEM断层扫描系统采用算法的软件，实现了从获取连续倾斜图像到三维重构整个过程的自动化。
精细的三维重构系统
TEM断层扫描系统实现了从获取连续倾斜图像到三维重构整个过程的自动化。为使电子断层扫描的各种调整能够自动化，TEM断层扫描系统采用了算法的软件（Recorder、Composer和Visualizer-Kai）。
Recorder
该软件能够在短时间内自动获取断层成像需要的连续倾斜图像。
为了提高三维重构的精度，需要以一定的角度为步长倾转样品，并尽量获取更多的图像作为原始数据。从按照设定的步长倾斜样品开始，到倾斜过程中的飘移补偿、聚焦调整以及图像获取，都可以自动进行。
Recorder操作画面
Composer
该软件能将获取的连续倾斜图像利用计算机断层成像技术进行三维重构。
电子断层成像技术的关键是图像数据的准确对齐，Composer软件通过对倾斜轴立体位置的计算和角度信息的精确分析等解决了这一难题。因此，可以在短时间内进行高精度的三维重构操作。
Visualizer-Kai
该应用软件能将三维重构后的图像数据，用体绘制或面绘制等各种方式显示，并且在显示屏上可以自由自在地观察。
使用鼠标可以自由移动立体图像，此外，Visualizer－Kai软件还具备测长功能。
高倾斜样品台（选配）
大倾斜角度下获取图像时，需要使用高倾斜样品台。
三维重构的应用实例：Tight junction的三维结构分析
【测试条件】
加速电压：120 kV
倾斜角度：±65°、1°/步
样品：Tight junction即紧密连接(老鼠小肠上皮、样品厚度为70 nm)
样品说明：Tight junction（紧密连接）是存在于脊椎动物上皮细胞顶端区域的细胞连接结构。
Fig. 1 TEM Image of Tight Junction
Tight junction（紧密连接）：相邻细胞之间的细胞质膜紧靠在一起，能起到屏蔽水及离子渗透的作用。
下面使用EM-05500TGP对紧密连接处细胞质膜的三维形态进行分析。
tight junction的体绘制图像
tight junction的切片图像
测长
Visualizer-Kai能够测长
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